由上海市第一妇婴保健院院长、妇科主任医师王育教授与上海宋庆龄基金会共同发起设立。卵巢癌等妇科肿瘤严重威胁着女性的生命健康，国内部分地区妇科诊疗水平较低，许多妇科癌症患者发现病情时较晚，失去了治疗机会，甚至因病返贫。本专项基金旨在通过资助困难患者、提供医师培训、推广科普宣教等多种形式，提升不同地区妇科肿瘤的诊疗水平，让患者获得正规治疗机会，进一步保障广大妇女的生命健康。
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由马晓辉于2023年1月9日发起设立。
专项基金将重点资助“一把二胡行天下”公益项目；
支持青少年、女性艺术家开展文艺创作、学术交流，支持中华传统文化的传承和推广；
支持乡村振兴、艺术疗愈等新领域的拓展。 -
由上海宋庆龄基金会和上海尚平文化发展有限公司于2022年发起设立。
支持举办2022和平鸽杯中国、东帝汶国际文化交流大赛；
支持关爱儿童美育及精神文化提升，促进国际交流和发展类公益项目。
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由上海宋庆龄基金会和上海浦置瑞滨企业管理咨询有限公司（香港置地全资子公司）于2022年8月共同设立。
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由上海宋庆龄基金会和浙江森马服饰股份有限公司旗下童装品牌巴拉巴拉，于2022年4月共同设立。
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上海宋庆龄基金会嘉靖慈善专项基金由李渡女士和乔靖女士联合上海宋庆龄基金会共同发起成立。基金将主要用于6-18岁青少年心理健康关怀相关项目，旨在呼吁全社会关注青少年心理问题。推动青少年身心全面健康发展，培养青少年独立健全的人格、形成自信自强的精神品质，给青少年的未来更多可能。
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由上海宋庆龄基金会和复旦大学附属耳鼻喉科医院发起成立，旨在为江西、贵州等地的妇女、儿童提供公益义诊、慈善手术、基层医疗设备捐赠以及举办医护人员眼科临床技能的培训，出版眼科疾病防控的科普读物，帮助社区和学校开展儿童青少年近视防控诊疗。
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上海宋庆龄基金会健康发展专项基金由美年大健康产业控股股份有限公司和上海宋庆龄基金会共同合作设立，合作期自2019 年10月30 日至2022年10月30日。基金将主要用于以下公益项目：帮助提升贫困地区妇女儿童疾病的筛查水平；提高贫困地区妇女儿童的健康认知。
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上海宋庆龄基金会九院耳聋及罕见病专项基金由上海交通大学医学院附属第九人民医院和上海宋庆龄基金会于2019年2月28日共同合作设立，合作期三年。基金将主要用于以下公益项目：帮助因家庭贫困而得不到合理医治的耳聋及罕见病患者；资助在耳聋及罕见病患者诊治领域的科学研究、人员培训及人才培养；疾病的科普宣传活动，如出版科普读物、举办科普讲座等。
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上海宋庆龄基金会美孕专项基金由上海虹口长江医疗产业投资管理（集团）有限公司与上海宋庆龄基金会在2019年3月共同设立。上海虹口长江医疗产业投资管理（集团）有限公司从事不孕不育医疗生殖领域，在丰富的生命、和谐的社区、友好的世界、绿色的地球等四个领域积极履行社会责任。
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