上海宋庆龄基金会上海永嘉人医疗专项基金自2017年3月设立，由上海永嘉商会发起。本基金将为永嘉籍病患者尤其是贫困患者到上海问诊就医，搭建平台、提供帮扶，最终造福广大患者。为永嘉人推动慈善事业，在沪寻医问诊、扶助病患、专家义诊、爱心助学为一体的公益支持。
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上海宋庆龄基金会大爱助行专项基金是由上海宋庆龄基金会和张楚吴女士于2016年7月共同创立，基金主要关注儿童脑瘫医治领域。
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上海宋庆龄基金会 活泼中国儿童癌症专项基金由上海宋庆龄基金会和VIVA中国儿童癌症基金会于2015年共同设立。致力于帮助在中国的白血病患儿及其家庭。通过成立中国儿童癌症研究协作组，更好地为白血病患儿及其家庭提供帮助。
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该公益基金由上海宋庆龄基金会携手上海市关心下一代研究中心共同设立，主要资助以儿童健康发展为核心的项目。在该公益基金的支持下，关爱外来务工人员子女以及帮助困境中的儿童成长的公益项目陆续开展，致力让这些在特殊环境中成长的儿童能和正常孩子一样体验快乐童年。
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上海宋庆龄基金会东亚银行专项基金由上海宋庆龄基金会和东亚中国于2009年11月共同发起成立。该基金旨在关爱和帮助贫困地区青少年的教育成长。 该基金主要资助的三大项目为： 1、萤火虫计划； 2、东亚银行助学金计划； 3、民间公益组织资助计划。
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2013年由邱海宁女士联合上海宋庆龄基金会发起成立，旨在支持母婴平安项目。
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凯心公益于2011年由凯龙瑞集团创始人及主席郑喜明先生倡导成立。2014年，上海宋庆龄基金会与上海凯龙瑞项目投资咨询有限公司联合发起设立“凯龙瑞公益专项基金”，2023年9月起更名为“凯心公益专项基金”。专项基金秉承“凝聚力量回馈社会”的宗旨，通过爱心举牌和爱心跑等活动，凝聚业界企业及各界朋友的爱心，致力于助学、助幼以及可持续发展等公益项目。
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上海宋庆龄基金会涵公益专项基金是上海宋庆龄基金会旗下的公益基金，于2013年7月设立，基金主要用于开展妇女儿童福利事业和社会可持续发展项目。
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2014年8月，由郭襄颖博士发起的上海宋庆龄基金会慈爱感恩妈妈之家专项基金在上海宋庆龄基金会正式设立。该基金关注贫困地区，特别是四川、西藏等少数民族聚居区域贫困家庭妇女与儿童的生存状况。
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“骨癌”是青少年最常见的骨原发性恶性肿瘤，致死及致残率高，对患者的家庭是一个巨大的经济负担。为帮助病患家庭、加强全社会针对该类疾病的科学认识、认真贯彻宋庆龄主席“一切为了孩子”的公益指导思想。上海宋庆龄基金会与上海市第一人民医院合作设立“上海宋庆龄基金会公济青少年骨癌专项基金”。
本专项基金主要致力于以下三个方面：
1、帮助因家庭困难而得不到合理医治的青少年儿童患者
2、资助在骨癌领域取得杰出成绩的科学研究
3、疾病的科普宣教，提高社会对本疾病的认识和重视，以及对患者的关爱
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